进化论因为支持“淘汰”机制，不免令人感到“残酷”。并非每个个体都有信心参与“适者生存”的竞争。失败者不愿意承认自己懒惰与游手好闲。福利国家养懒汉，公有制吃大锅饭导致人们只吃不干，大食堂吃起来无比浪费，《济贫法》让游手好闲者衣食无忧。斯宾塞这样捍卫正义、法律前提下的公平竞争，常被斥为不道德。进化论者后来竟成了帝国主义者的又一别称。然而，事实上，与人们想象中相反，斯宾塞是一个主张道德、反对帝国主义侵略的人。他视战争为大恶，认为英帝国主义政策在道义与利益上皆说不过去。[151]他认为，各民族之间应当提倡兄弟之爱，化剑为犁，化刀为锄。他还指出，那些自我标榜为道德家、和平主义者的人，虚伪至极。
关于道德、伦理，斯宾塞有专著论述。他认为，人的很多活动不涉及道德，因为其目标单一，不涉及选择。只有在探讨哪一种方式好、哪一种方式坏时，才遇到道德问题。此时，人们要虑及其效果。不道德、反社会的行为，总是会危及社会机体的存活，而道德行为，则维持或促进着社会整体的运行。[152]良心、平等待人、办事公正，都是极重要的道德准则。道德行为带来了文明的进步，在这种进步中，个体得到充分发展，个性得以张扬，社会因此变得越来越异质。但由于各人之间广泛的合作分工，社会联系反而日益复杂、紧密。这区别于前工业社会中“各人自扫门前雪”的状况。
斯宾塞持一种乐观的均衡理论，他认为，正如生物进化一样，人的行为的进化同样是朝向一种均衡的运动。人的道德水平，会在进化中日益提高。进化到极限，便是个体得到充分发展，愿意与他人充分合作。斯宾塞思想中有一个关于充分进化的完善社会（complete society）的理想。[153]正是在此点上，他的学说激发了克鲁泡特金的无政府主义。英国费边社的社会主义，也从中受惠甚多。
斯宾塞提出了一个关于“相等自由”的法则（law of equal freedom），以之作为工业社会构成之政治、法律与伦理的原则。这个原则的具体表述是：“每个人可以自由地做他想做的事，但不能侵犯任何其他人所持有的同等的自由。”[154]由此，每个个体有天赋权利，其自由与任何其他个体相等。道德的正确，即由此而来。这一原则不仅适用于工业社会之内，也适用于各个社会之间。他说，布尔人有完全的自由推翻强加在他们头上的统治。任何民族，皆提不出正当理由去侵略其他民族。任何个体，也绝不容其他人无端侵害。他自己即拥有天然的权利，以捍卫自己的人格及财产。军事社会视征服获得的胜利为荣，工业社会则以和平、自由为荣。他激烈抨击英国的帝国主义政策：“在我们自己中间，殖民地事务的行政部门就非常残酷，当土著居民试图向一个曾伤害过他的英国人报复时，惩罚并不按野蛮人一命偿一命的原则，而是按所谓高级、文明的民族对土著实行全体屠杀的原则。”[155]他宣称，对其他民族的暴行必将对本国国内的统治造成影响。因为没有谁可以把在国内大谈平等的福音与在国外从事不平等的勾当统一起来。[156]